《西学东渐与中国高等教育近代化》，厦门大学出版社，1995年
《高等学校职能论》，黑龙江教育出版社，1998年
《挑战与创新：新经济与中国高等教育》，南京师范大学出版社，1999年
《高等教育科学发展研究》，光明日报社，2000年
《教育体制改革：科教兴国战略下的选择》，党建读物出版社，2004年
《教育模式比较研究》，国家委托重大课题，2009年
《进一步强化科教兴国战略  全面推进教育改革与发展——中国教育发展战略研究》，国家“十二五”规划课题，2010年
《中国教育体制改革：回顾与前瞻》，《中国社会体制改革蓝皮书2013》，社会文献出版社，2013年。
《中国教育体制改革全面深化》，《中国社会体制改革蓝皮书2014》，社会文献出版社，2014年。